成都市第二人民医院市科技局课题《基于人工智能模型的肺间质异常的早期检测、精准干预策略及应用示范研究》测序与生信分析服务采购项目挂网公告
成都市第二人民医院，本着公正、公平、公开的原则，拟对“成都市第二人民医院市科技局课题《基于人工智能模型的肺间质异常的早期检测、精准干预策略及应用示范研究》测序与生信分析服务采购项目”进行比选，兹邀请符合要求的供应商参加比选。
一、项目编号：XK-（2025）8号。
二、项目名称：成都市第二人民医院市科技局课题《基于人工智能模型的肺间质异常的早期检测、精准干预策略及应用示范研究》测序与生信分析服务采购项目。
三、比选内容：
比选确定1家供应商承担成都市第二人民医院市科技局课题《基于人工智能模型的肺间质异常的早期检测、精准干预策略及应用示范研究》测序与生信分析服务采购项目。
序号 | 名称 | 规格 | 参数 | 预估数量 | 最高限制单价（元） |
1 | 转录组测序 | 例 | 一、样本类型：外周全血 二、服务内容：样本的转运、RNA提取、质控、文库构建、上机测序 三、交付形式:所有原始数据、分析结果、可视化图表及分析报告。 四、技术服务详细要求： 1.总RNA提取与质控:使用经认证的去球蛋白RNA提取试剂盒。提供每个样本的RNA质量评估报告，包括但不限于：浓度、纯度（OD260/280）、完整性（RIN值）、电泳图。要求所有样本RIN值 ≥ 7.0。 2.文库构建与测序: 建库方案: 使用poly(A)富集法进行mRNA建库。 测序平台: Illumina NovaSeq 6000或其他同等性能平台。 测序模式:PE150 (双端150bp) 数据量:每样本有效测序数据量 ≥ 50 million raw reads。 | 100 | 830 |
２ | 生信分析 | 组 | 一、原始数据质控： FastQC质量评估、Adapter去除、低质量 reads 过滤，提供质控总结报告 二、序列比对与定量： 使用STAR/Hisat2等软件比对至最新版本人类参考基因组（如GRCh38）。使用featureCounts或HTSeq-count进行基因计数，提供比对率、唯一比对率等统计结果 三、差异表达分析：使用R包进行ILA组 vs 对照组的差异表达基因（DEGs）分析，提供DEGs列表（包括log2FC, p-value, adj.p-value）、火山图、热图 四、功能富集分析：对显著上/下调的DEGs进行GO功能注释、KEGG通路富集分析、GSEA基因集富集分析，重点关注纤维化、免疫炎症、细胞外基质相关通路。提供富集气泡图、条形图 五、免疫细胞浸润分析： 必须使用CIBERSORTx或类似去卷积工具，量化每个样本中22种免疫细胞亚群的比例 比较组间免疫细胞比例差异，并提供箱线图、堆叠图及相关性分析结果 六、机器学习与标志物筛选： 基于差异表达基因和WGCNA核心基因，使用LASSO回归或随机森林等算法，构建最小基因集诊断模型 提供模型特征基因列表、在训练集上的ROC曲线（AUC值）、模型系数 七、数据交付物要求： 1.原始数据:交付FastQ格式的原始测序数据。 2.过程数据:基因表达矩阵（counts, TPM, FPKM格式）、差异表达分析结果表格、免疫细胞比例表格等。 3.结果报告:一份完整的中文分析报告（PDF格式），详细描述分析方法、步骤、结果及初步生物学解读，并包含所有高质量的可视化图片（PDF及可编辑格式，如.eps或.svg）。 4.代码:提供本次项目所有的分析脚本（如R/Python代码）。 | １ | 85800 |
本项目总预算16.88万元，结算总价不超过项目总预算。
四、合格比选申请人条件：
1、具有独立承担民事责任的能力；
2、具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度；
3、具有履行合同所必需的设备和专业技术能力；
4、具有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录；
5、参加本次采购活动前三年内，在经营活动中没有重大违法记录；
6、本项目不接受联合体。
五、报名及比选文件领取时间、地点：
请有意向的申请人于挂网次日起3个工作日内上午8：30-12:00，下午2:30-5:30（北京时间，法定节假日除外）在成都市第二人民医院庆云院区2号楼16楼学科建设办公室/龙潭院区科教楼3楼学科建设办公室进行资质预审和报名，符合报名条件后领取比选文件（电子版）。
资质预审时须携带下列有效证明文件：
1、营业执照、组织机构代码、税务登记证（三证合一的提供营业执照）；
2、良好的商业信誉和健全的财务会计制度（提供承诺函）；
3、履行合同所必需的设备和专业技术能力（提供承诺函）；
4、具有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录（提供承诺函）；
5、法定代表人身份证复印件；法定代表人授权书原件和被授权人身份证复印件（非法定代表人参加报名时提供）；
6、参选人没有任何违法违规不良记录的承诺（提供承诺函）；
注：以上6项均加盖鲜章，承诺函格式自拟。
六、比选申请文件的递交及截止时间和比选时间：
比选时间、地点：另行通知。逾期送达或密封和标注不符合比选文件规定的比选申请文件恕不接受。本次比选不接受邮寄的比选申请文件。
七、本次比选邀请将在成都市第二人民医院官方网站（http://www.cd2120.com）以公告形式发布。
八、联系方式：
采购人：成都市第二人民医院；
联系人：学科建设办公室 付老师
联系电话：028-67830396 / 028-67838830
邮 箱：cdeyyxkb@163.com
监督电话：67830816 67838814